Vào những năm cuối đời, khi Altair-một sát thủ huyền thoại, cố vấn của Hội sát thủ biết được ý định tấn công pháo đài Masyaf, ông đã cho di tản hội và sử dụng Quả Táo Địa Đàng (Apple Of Eden) để đồ sát quân Mông nhằm giúp các sát thủ có thời gian rút lui. Dù việc này có thể cầm chân được quân Mông nhưng sức mạnh là có hạn, ông cũng đã 92 tuổi rồi, dù rằng quyền năng của Quả Táo Địa Đàng rất lớn nhưng cũng không thể chống trả lâu hơn, và ông đã phải rút lui cùng hội huynh đệ sát thủ (Assassin brotherhood).

Tuy hội sát thủ đã ẩn mình hoạt động trong bí mật, nhưng đồng thời họ cũng tản ra khắp nơi, lập lên các chi nhánh của hội trên toàn thế giới, thực hiện những công việc mang tính chất thầm lặng và kín đáo hơn. Hội đã có rất nhiều các chi nhánh khác nhau ở khắp các quốc gia trên thế giới với những sát thủ mang tính biểu tượng như Ezio Auditore, Connor, Altair, Arno Dorian,...

Đến thế kỷ XIII, khi quân Mông Cổ đang là bá chủ của thế giới với lãnh thổ trải giải khắp Á Âu, họ thực sự là nỗi khiếp sợ của toàn thế giới lúc bấy giờ.

-Th...thưa ngài, quân Mông Cổ đã chiếm được phần lớn Trung Hoa!
-Mông Cổ đang ngày càng bành trướng, nếu họ chiếm được toàn bộ thế giới này, thì có lẽ hội sát thủ sẽ phải sụp đổ mất! (Altair cảm thán, ông đang lo lắng cho tương lai của Hội)
-Chúng ta có kha khá sát thủ đang hoạt động ở Trung Hoa, nhưng phần lớn bọn họ đã phải chạy sang Đại Việt hoặc Nam Tống.
-Đại Việt? Đó là đất nước ở phương Nam à? Nhưng quân Nguyên cũng đang có ý định xâm lược Đại Việt để làm bàn đạp đánh Tống, ta sợ rằng một đất nước nhỏ bé sẽ không thể cầm cự lâu với sức mạnh của kỵ xạ Mông Cổ đâu.

Một sát thủ khác bất ngờ xông vào:
-C...cấp báo! Quân Mông-Nguyên đã tấn công Đại Việt và đã chiếm được kinh thành Thăng Long!
Altair dường như đã đoán trước được tình hình, ông bình tĩnh nói:
-Sinh mệnh của ta không kéo dài được lâu nữa. Sau khi ta ra đi, nếu quân Nguyên đánh bại Đại Việt và Nam Tông hãy cầm thứ này đến, sức mạnh của nó sẽ giúp hội của chúng ta có thể cầm cự được cho đến lúc có thể thoát khỏi sự truy sát của quân Nguyên.
-N..n.ó...là...là QUẢ TÁO ĐỊA ĐÀNG sao!?
Mọi người ai lấy đều không khỏi bất ngờ
-Không còn cách nào khác nữa rồi.
Nói xong Altair thở dài

Nhưng đến lúc chết, Altair cũng không thể ngờ rằng đất nước nhỏ bé ở phương Nam xa xôi ấy đã đánh bại được một trong những đế quốc mạnh bậc nhất lịch sử thế giới. Cả hội Huynh đệ Sát thủ lẫn những Hiệp sĩ dòng Đền (Templar) đều không thể tin nổi.

-Quả thật, chúng ta không thể coi thường đất nước này. Một đất nước tuy nhỏ bé nhưng đã khiến cho một đế quốc phải bại trận dù đã mất cả kinh đô.
Mọi người cảm thán.
-Nếu chúng ta không đến và lập chi nhánh ở Đại Việt, thì sớm muộn bọn Templar sẽ làm điều đó. Đã đến lúc hành động rồi!
Người cố vấn nói, cả hội ai lấy đều đồng ý với quyết định này và quyết định sẽ lập một chi nhánh ở Đại Việt.