Vào năm 2017, nhân loại phải đối mặt với đại hoạ được gọi là "Universe Paradox" và đã thay đổi mọi thứ đưa nhân loại đến với một kỉ nguyên mới, kỉ nguyên của các NGUYÊN TỐ. Sau sự kiện U.P bắt đầu xuất hiện những đứa trẻ mới sinh ra mang trong mình những sức mạnh khác nhau bao gồm mộc, thuỷ, hoả, thổ, lôi, phong, quang, bóng tối và 1 khả năng đặc biệt là thời gian. Với những đứa trẻ không mang những sức mạnh nguyên tố sẽ có triển vọng làm nhà giả kim thuật sư.

100 năm sau U.P thế giới dần ổn định, để kiềm kiềm chế những sức mạnh con người đã xây lên những nơi kiềm chế dưới mác những trường học gọi chung là Học Viện Nguyên Tố. Cán cân thế giới thay đổi, mọi người bắt đầu phân biệt nhau bằng sức mạnh.

Các nhà nước khác nhau bắt đầu đứng lên liên minh lại lập ra nhiều tổ chức khác nhau để kiềm chế lại nhưng sức mạnh với mức độ nguy hiểm cao đó. Và kèm theo đó là những thí nghiệm và lợi dụng sức mạnh đó cho những việc đen tối lợi nhuận cá nhân.

Những học viện nguyên tố xuất hiện tại nhiều nơi trên thế giới như Mĩ, Anh, Nga, Nhật,...Những học viện được coi như một trường học cao trung với 3 khối và mỗi khối có 5 lớp. Từng lớp trong mỗi khối đều được xếp hạng riêng từ hạng S=>A=>B=>C=>D với S là những lớp đứng đầu về năng lực.