Miyuki cùng chồng bị bắt giữ vào ngày 15/1/1948 nhưng trong quá trình điều tra, cảnh sát phát hiện những sự thật rùng rợn hơn họ nghĩ. Trong khi cảnh sát đang tiến hành thẩm vấn nghi phạm và chờ đợi một phiên tòa, cuộc điều tra đã dẫn họ và thám tử đến một ngôi đền nơi họ tìm thấy khoảng 30 thi thể em bé sơ sinh được chôn cất trong khuôn viên và khoảng 40 thi thể khác trong ngôi nhà của 1 người đã chết. Tất cả đều chết theo cách giống như 5 đứa trẻ được phát hiện ban đầu.

Các nhà chức trách không thể thống kê chính xác được số lượng trẻ đã chết dưới tay "bảo mẫu ác quỷ ấy". Con số chính thức được đăng trên các tờ báo lúc bấy giờ là 103, tuy nhiên người ta tin tổng số trẻ chết ít nhất là 169.

Trước tòa, ả đàn bà tàn ác này còn luôn miệng chối tội. Bà ta tuyên bố trong phiên tòa rằng mình không liên quan gì đến chuyện này và lời giải thích được đưa ra là cha mẹ của những đứa trẻ đã bỏ rơi chúng vì không đủ khả năng nuôi dưỡng.

Cơ quan điều tra không thể thu thập đủ bằng chứng kết tội Miyuki Ishikawa và chồng, nên tòa án tối cao Nhật Bản buộc phải kết tội ả 8 năm tù giam vì tội "vô trách nhiệm gây ra hậu quả nghiêm trọng", người chồng chịu mức án 4 năm tù. Sau đó, họ kháng cáo khiến tòa phải giảm một nửa hình phạt, Miyuki chỉ ở tù 4 năm còn chồng bà ta ở tù 2 năm.

Bản án này gây phẫn nộ và bức xúc trong dư luận Nhật Bản bởi ai cũng cho rằng nó quá nhẹ đối với tội ác tày trời mà vợ chồng bảo mẫu ác quỷ này gây ra.