Sau khi phá hủy các điểm phát sóng và ngăn chặn kế hoạch của Shadow Corporation, Nobita và nhóm đặc vụ trở lại căn cứ của tổ chức chống vũ khí sinh học. Mặc dù họ đã ngăn chặn được thảm họa, nhưng những câu hỏi về mục tiêu và quy mô thực sự của Shadow Corporation vẫn còn đeo bám họ.Tại căn cứ, Nobita và Kuro báo cáo tình hình cho chỉ huy trưởng, ông Tanaka.Chỉ huy Tanaka: "Các cậu đã làm rất tốt. Nhưng chúng ta vẫn chưa biết hết về Shadow Corporation. Họ còn nhiều bí mật ẩn giấu mà chúng ta cần khám phá."Kuro: "Chúng tôi đã tìm thấy một số tài liệu quan trọng trong phòng điều khiển của họ. Chúng có thể chứa manh mối về kế hoạch tiếp theo của Shadow Corporation."Nobita và Kuro mở các tài liệu ra và bắt đầu nghiên cứu. Trong khi đó, các đặc vụ khác tiếp tục công việc điều tra và bảo vệ căn cứ. Một bầu không khí căng thẳng bao trùm, khi mọi người đều cảm nhận được rằng đây chỉ là sự khởi đầu của một cuộc chiến dài lâu.Trong số các tài liệu, Nobita phát hiện một bản đồ chi tiết về một cơ sở bí mật khác của Shadow Corporation, nằm sâu trong khu rừng rậm ở Nam Mỹ. Bên cạnh đó, còn có những ghi chú về một loại vũ khí sinh học mới, mạnh hơn và nguy hiểm hơn loại virus trước đó.Nobita: "Chúng ta cần phải đến Nam Mỹ để tìm hiểu thêm về cơ sở bí mật này. Nếu họ đang phát triển một loại vũ khí sinh học mới, chúng ta phải ngăn chặn trước khi quá muộn."Chỉ huy Tanaka đồng ý và lên kế hoạch cho một nhiệm vụ mới. Nobita, Kuro, và một đội đặc vụ tinh nhuệ được giao nhiệm vụ điều tra cơ sở bí mật của Shadow Corporation ở Nam Mỹ.Sau một chuyến bay dài, nhóm đặc vụ đến được khu rừng rậm nơi cơ sở bí mật tọa lạc. Với trang bị đầy đủ và kỹ năng sinh tồn, họ bắt đầu tiến vào rừng, vượt qua những chướng ngại tự nhiên và đối mặt với các nguy hiểm tiềm tàng.Khi đến gần cơ sở, họ nhận thấy nơi này được bảo vệ nghiêm ngặt với nhiều lớp an ninh. Các đặc vụ phải sử dụng tất cả kỹ năng của mình để lẻn vào mà không bị phát hiện. Họ tiến vào sâu hơn, phát hiện ra những phòng thí nghiệm ngầm, nơi các nhà khoa học đang tiến hành những thí nghiệm kinh khủng.Nobita: "Chúng ta phải lấy được bằng chứng và tiêu diệt cơ sở này. Không thể để chúng tiếp tục phát triển loại vũ khí sinh học mới."Nhóm đặc vụ bắt đầu thu thập thông tin, chụp ảnh và sao chép dữ liệu từ máy tính. Họ phát hiện ra rằng Shadow Corporation không chỉ có kế hoạch phát triển vũ khí sinh học mà còn có ý định tấn công các thành phố lớn trên khắp thế giới.Khi họ chuẩn bị rời khỏi, một nhóm lính canh phát hiện ra sự hiện diện của họ. Còi báo động vang lên, và một cuộc chiến ác liệt nổ ra trong lòng cơ sở bí mật. Nobita và các đặc vụ phải chiến đấu quyết liệt để bảo vệ những bằng chứng quan trọng mà họ đã thu thập.Cuối cùng, sau một trận chiến căng thẳng, nhóm đặc vụ thành công trong việc tiêu diệt các lính canh và phá hủy cơ sở bí mật. Họ rút lui an toàn với những bằng chứng quan trọng trong tay.Trở về căn cứ, Nobita và nhóm đặc vụ báo cáo lại những phát hiện của họ. Những bằng chứng này giúp chỉ huy Tanaka và các lãnh đạo khác hiểu rõ hơn về quy mô và mục tiêu thực sự của Shadow Corporation.Chỉ huy Tanaka: "Chúng ta đã có thêm nhiều thông tin quan trọng. Nhưng cuộc chiến vẫn còn tiếp diễn. Chúng ta phải luôn sẵn sàng để đối mặt với những thách thức mới."Nobita: "Chúng ta sẽ không dừng lại. Chúng ta sẽ tiếp tục chiến đấu cho đến khi Shadow Corporation bị tiêu diệt hoàn toàn."Với tinh thần quyết tâm, Nobita và nhóm đặc vụ chuẩn bị cho những nhiệm vụ tiếp theo, sẵn sàng đối mặt với mọi nguy hiểm để bảo vệ thế giới khỏi các mối đe dọa từ vũ khí sinh học.