1. Transformaciones-Habiéndose aislado de todos tras los últimos sucesos trabajando como profesor de instituto, a la vez haciendo su doctorado, tras detener a unos jóvenes criminales, Spider-Man tiene un encuentro inusual con una misteriosa persona con sus mismas habilidades, identificándose como Ezekiel Sins, diciéndole que se prepare para lo que viene por su propia existencia. Mientras, el trepamuros ha estado siendo observado por un misterioso grupo desde las sombras, liderado por el Sr. Negativo.

(Basado en The Amazing Spider-Man Nº 471)

2. La araña que lo tenía todo-Despertando una mañana como cualquier otra, Peter ve no solo que sus padres y tíos están vivos, sino que tiene una carrera exitosa, está a punto de casarse con su novia, y además alguien más ha tomado el manto de Spider-Man. Pese a la felicidad inicial, pronto verá que ese mundo no es tan perfecto, siendo una retorcida pesadilla causada por un moribundo Mysterio por cáncer y consumido por la fantasía en su último encuentro.

(Basado en Daredevil: Guardian Devil)

3. Regresando a casa-Aun pensando en lo dicho por Sins, no viendo nada malo en él, Parker decide poner su vida en orden, reconciliándose con su hermano clon y amigos, como regresando con Mary Jane. Mientras tanto, una nueva Black Cat, la propia Samantha, ha estado investigando los extraños robos de tecnología que un hombre puma ha estado haciendo bajo encargo del autoritario empresario mexicano, Tomas Corazón de Fuego, siendo en realidad la misma persona. En el cementerio, los Demonios Internos roban el cadáver de Norman Osborn.

(Basado en The Amazing Spider-Man Nº 256, 257 y 472)

4. Los Herederos-Uniéndose la nueva Black Cat al grupo, Ezekiel rebela que el Puma es uno de Los Herederos, además de relatar su historia como secta milenaria que por poder y ambición ah ofrecido como sacrificios a diversos tótems animales, además de rebelar que Parker es un tótem original, el nuevo deber del grupo es identificar a los demás Herederos, sospechando inmediatamente de cierto conocido, Kingpin, el cuál planea su fuga de la cárcel, haciendo un trato con Hammerhead para recuperar su poder.

(Basado en The Amazing Spider-Man Nº 473)

5. El fin de la tierra-No habiendo evitado la fuga de Kingpin, Ezekiel presenta a su hija adoptiva de otra dimensión, Cindy Moon, alias Silk, uno de los últimos tótems originales, hiendo ahora en busca del siguiente potencial sospechoso, el Dr. Octopus, encontrándolo moribundo con sus nuevos Seis Siniestros, Buitre, Camaleón, Hydroman, Molten Man y el Escarabajo, queriendo causar el fin de la tierra desde su satélite espacial para consolidarse como un gran criminal en el fin de sus días. Mientras tanto, en un lugar desconocido como aislado, los Demonios Internos hurtan otra tumba sin nombre.

(Basado en The Amazing Spider-Man Nº 682 a 687)

6. Big Man al descubierto-Recordando que Betty y Robbie, ahora casados, una vez le contaron que ciertas cosas raras ocurren en el Daily Bugle desde que Foswell manda, Spider-Man cree que podría ser otro Heredero, debiendo recurrir al retirado y ahora pacífico Jameson tras sobrevivir a su infarto para ingresar al conocer el edificio de arriba a abajo, teniendo un encuentro con los Ejecutores, descubriendo que estaba en lo cierto, además de descubrir que Foswell siempre ah sido Big Man.

7. Mortalidad a cualquier costo-Sabiendo gracias a Ock y Big Man que Los Herederos buscan la tabla hermana de la Tabla de la Inmortalidad, la Tabla de la Muerte, que daría control a cualquiera de la vida y la muerte a quien la posea, poseyendo dos pedazos de ella, sabiendo que sería algo que llamaría la atención del Sr. Negativo, el cuál es más poderoso que nunca al haber estado absorbiendo energía de la llamada Zona Negativa, un mundo monocromático y lúgubre que encierra varios horrores inimaginables, despertando un sentimiento de venganza en Silk al ser el ser que devasto su mundo, tratándose de una trampa de Los Herederos.

8. La caída-Poseyendo Los Herederos todas las partes de la tabla, finalmente logran traer de vuelta a la vida a lo que Ezekiel tanto temía y no rebelo en primer lugar para no alarmar a nadie, Morlun, una temible criatura milenaria que hace años dio muerte, la cual ha absorbido el cadáver de Norman. Spider-Man se enfrenta a Morlun, pero no se da cuenta de cuán poderoso es realmente pese a su débil apariencia hasta que lo deja literalmente casi muerto al chuparle la energía tras horas de lucha, sin que sus compañeros puedan hacer nada para evitarlo.

(Basado en The Amazing Spider-Man Nº 474 y 526)

9. El Otro-Encontrándose Parker muerto en coma, no sabiendo que hacer los demás al ser algo que nunca habían combatido antes, refugiándose en la torre de Ezekiel, que no deja de sentir culpa, mientras Morlun ahora más vigoroso y poderoso, en una completa muestra de obsesión y locura absoluta, el Dr. Octopus se ah autonombrado el nuevo Spider-Man al estar su muerte en un cuerpo clonado de Peter, renombrándose el Superior Spider-Man, debiendo Scarlet Spider y el Merodeador detener su farsa, recibiendo la inesperada ayuda del Escorpión y Venom, junto a un ejército de simbiontes, que sienten insultante que un villano reemplace a un héroe.

10. Multiverso araña parte 1-Mientras tanto, el alma de Peter, perseguida por una sombría entidad llamada Shattra, vaga por el multiverso, encontrándose con la enigmática Madam Web que lo ayudara a recuperar su cuerpo, enseñándole sobre la importancia del multiverso araña con la Telaraña de la vida, el órgano espacio temporal que mantiene todos los universos arácnidos funcionando, rebelándole más sobre Morlun; el propio Norman Osborn lo hizo contactar sin querer con su universo cuando trato de recrear el accidente que lo transformo en Spider-Man y que lo convirtió en el Duende Verde al absorber parte de la personalidad del ente.

11. Multiverso araña parte 2-Debiendo pasar el juicio de la Telaraña de la vida para ver si es digno de portar o no su manto al no ser un tótem original, Peter deberá combatir de una vez sus demonios internos al enfrentarse y darle fin a Shattra, entendiendo su gran importancia dentro de la Telaraña de la vida.

12. Resurgimiento-Organizando los amigos y conocidos de Parker una resistencia frente al avance imparable de Morlun y Los Herederos, buscando el cuerpo de Peter para completar su sacrificio que abrirá todo el multiverso para su buffet, Los Herederos se desunen al buscar sus propios intereses; Kingpin asesina a Foswell en su intento por proteger a Jameson al arrepentirse, el Puma usa la tecnología hurtada para encontrar una versión de su fallecida familia en el multiverso, y el Sr. Negativo intenta regresar a la normalidad, todo eso entremezclado con el esperado despertar de Spider-Man.

13. Destino final-Spider-Man tiene una batalla más equilibrada con Morlun, tras sobrecargarse de la energía de los mundos que Morlun destruyo que claman venganza, además de ayudarlo Ezekiel, sin embargo, la alta resistencia del ente, junto a la determinación de Parker, definirán el destino del multiverso y su mundo. A su vez, Scarlet y el Merodeador se encargan del Puma, mientras Silk ayudada de MJ y Gwen le da fin al Sr. Negativo, pese al coste de su propia vida.

14. Epilogo (Final de la serie)-10 años después de la muerte de Morlun y Ezekiel, habiendo borrado Madam Web a la memoria todos sobre la identidad de Spider-Man, salvo a sus amigos y uno que otro conocido, Peter y MJ se casaron, teniendo dos hijos, May y Ezekiel. Se fundo Parker Industries en Chicago, empresa dedicada a la biotecnología para fines benéficos. Miles y Gwen también contrajeron nupcias, mudándose a Australia para vivir tranquilos. Ben ahora junto a Samantha continua combatiendo el crimen en Nueva York. Pese a todo, Peter aún continua siendo Spider-Man cada vez que se necesite o se requiera.