1. Eliminación grosera-Pasado un año del incidente de Saki y Hitogata, Media-San ah estado enseñándole más cosas a su hermana al respecto de buscar los Lost Media, a la vez que ha aumentado su vínculo con Media-Kun, como su hermano con Saki. Aún sin ninguna respuesta a la vista, un problema surge al salir de una televisión unas versiones groseras de Dexter y Diddie Diddie que empiezan a causar todo tipo de inconvenientes. Sin embargo, eso no es lo grave, sino la verdaderamente inesperada visita de los padres problemáticos de los hermanos, además de su abuelo paterno que quieren más que sus padres, el Gordo Alberto.

2. Un sujeto corto-Aceptando, por ahora, que sus padres se queden, con la condición que no discutan ni interrumpan su hacer diario. Saki continúa teniendo pesadillas respecto a su incidente, confesándole a Media-San que aún desea averiguar que paso con sus amigas, teniendo igualmente incidentes malos con los padres. Una figura similar a la de Mickey Mouse que afirma haber estado en Vietnam es perseguida por fuerzas similares al Viet Cong, solo para transformarse lentamente en una versión retorcida auto nombrada Suicide Mouse. Pese al lazo cercano que han creado, Media-San aún tiene dudas de ir más allá, como Saki por temor a perderlo.

3. Gogola-Pese al trato, los problemas entre los padres y los hermanos son inevitables, principalmente por su relación con Media-Kun y Saki. Mientras, un grupo de adolescentes ven a un monstruo gigante en el lago. Siendo el ser más grande y destructivo que el equipo ha enfrentado hasta ahora, el llamado monstruo indio Gogola llega a tierra, debiendo detenerlo antes que llegue al pueblo o el resto del país se entere de lo que ocurre allí, siendo realmente casi imparable. A su vez, Trope-Tan recibe la inesperada visita de su hermana menor Emma, la nombrada Wikipe-Tan, que podría ser la solución al problema.

4. Una situación incómoda-La incomoda reunión de las hermanas, teniendo rivalidad por quien almacena más información, además de sentirse Trope-Tan traicionada por ella cuando la dejo antes de poner su negocio de computadoras, se ve interrumpida cuando la pequeña sésamo Snuffy, con la que Trope Tan desarrollo amistad, pide ayuda al equipo por algo extraño que está pasando en su pueblo. Sin embargo, al llegar, descubren que en realidad la pequeña quiere evitar que sus progenitores se divorcien, debiendo hacerle entender junto a Hansel y Gretel, en base a sus experiencias, que eso no significa que sus padres ya no la quieran, y menos que es culpa suya, en medio de la venganza de Winkie.

5. Saki corre cuesta arriba-Aunque las hermanas han logrado dialogar más por el incidente de Snuffy, aún tienen muchas diferencias no resueltas, negándose Wikipe-Tan a formar parte del equipo. Buscando absorber el espíritu de Saki. Slenderman regresa acompañado de Jeff, Suicide Mouse y Ben Drowned, haciéndola caer en un gran trance tras atraerla al bosque donde no solo deberá enfrentar al ente junto a sus mayores temores, sino hacer las paces consigo misma. Combatiendo los demás al propio ente y sus lacayos, depende de ellos ayudar a su amiga por medio de su voz al hacerle recordar que solo los buenos momentos con sus amigas importan antes que sea tarde.

6. Estatus ambiguo-Sabiendo tras interrogar a Jeff que Slenderman pensaba absorber el alma de Saki para una figura mayor como mucho más sádica y peligrosa, Zalgo, un ser capaz de causar locura a cualquiera con solo su presencia, el equipo teme que se esté tratando de liberarlo. Suponiendo que el Sr. Kadabra podría tener más información al respecto, rebelando Saki que también la visito de niña, antes de buscarlo conocerán a Ambiancé, un extraño ser del que no saben si es bueno o malo o lo que podría hacer por su estatus realmente ambiguo. Tras insultar a Media-Kun y Saki tras encontrarlos a punto de besarse con sus hijos, además de sus constantes quejas por casi todo, los hermanos finalmente se cansan y echan a sus progenitores de su hogar, apoyados por su abuelo.

7. El pantano del ogro-Ya en Checoslovaquia, quedándose Mr. Softee y el Gordo Alberto con Midori, Doracat y Kekcroc en la tienda por su seguridad al ser el caso más peligroso que han tenido, no sabiendo exactamente en qué pueblo podría residir el mago, se separan para cubrir más terreno. Hablando sobre los sentimientos que tienen hacia su hermano, Media-Tan y Saki conocen en un pantano a un ogro huraño, pero de buen corazón en el fondo llamado Shrek que acepta ayudar, mientras Media-San y Media-Kun enfrentan a los llamados Dark Media liderados por Crack Master que ha agrupado a mayoría de sus enemigos anteriores. Teniendo una corta pelea física las hermanas que Sly detiene, Trope-Tan y Wikipe-Tan son las que tienen más suerte al encontrar al Sr. Kadabra.

8. Perdida de inocencia-Reunidos con el Sr. Kadabra, incomoda Saki al guardarle rencor por no haberla salvado, el mago cree que su vieja amiga Sally, con la que perdió contacto por su bien cuando escapo de la Checoslovaquia comunista junto a su madre años atrás, podría estar en peligro al ser Zalgo uno de sus principales enemigos. Transportados a Montreal, el mago y el equipo se dan con la desagradable sorpresa que ahora Sally es una empresaria mal humorada que no conserva nada de la dulce niña que era. A su vez, ha estado siendo acosada por Camera Head en busca de venganza al haber sido en realidad una reportera que se suicidio en vivo al quitarle su empleo. Wikipe-Tan finalmente acepta formar parte del equipo.

9. Un paseo por Perú-Decepcionado el Sr. Kadabra por la nueva actitud de Sally, enterándose que Quiromancia esta en su tierra natal, Perú, el equipo pronto va a buscarlo al saber que podría predecir lo que pasaría en un futuro cercano o lejano. Esto lleva a que conozcan a los buscadores de Lost Media de la región, Martina y Quirino, que han estado en busca de capturar al ente. Sabiendo que Zalgo es peligroso, ambos se unen al equipo, pese a la poca confianza que se tienen Media-Tan y Martina, debiendo aprender a trabajar en equipo. La revelación de Quiromancia sobre su posible destino solo consigue inquietarlos.

10. Paraíso limitado-Enormes protestas estudiantiles sacuden y toman la Universidad Sakurakoji de Sapporo. Inicialmente no queriendo intervenir por no tener nada que ver con lo que sucede, para Saki resulta ser un deja vu al recordar al antiguo líder de la protesta estudiantil, el anarquista Mutsuo Miyasaki que soñaba con crear un paraíso. Descubriendo que su yokai está impulsando la protesta, Saki descubrirá la verdad tras su incidente al haber sido él y sus compinches las que la encerraron junto a sus amigas en ese baño al negarse a apoyarlos como en no corresponderle, debiendo enfrentar al mismo lugar ayudada de Media-San y sus amigas al finalmente reencontrarse. Saki finalmente perdona al Sr. Kadabra tras hablar.

11. Horror inimaginable-Mizuki y Meiko se acercan al equipo para ayudar al también haber oído sobre Zalgo. Notando ciertas actitudes raras en ambas, se dan cuenta muy tarde que en realidad han sido poseídas por el ente para acercarse a Media-Tan para chuparle la vida como planeo. Encontrándose sus mentes originales en el bizarro como inquietante mundo de Zalgo, el Equipo deberá ayudar a las médium a recuperar sus cuerpos, como de sus compañeros y gente que posea el ente, enterándose de un hecho espantoso. Producto del incidente en su vieja universidad, Saki finalmente confiesa sus sentimientos a Media-San, correspondiéndose. Gracias a Sly, Trope-Tan y Wikipe-Tan se reconcilian.

12. Revelaciones-Ahora sabiendo que el depravado como cruel conquistador español Héctor De Soto es el heraldo de Zalgo, acompañado además de sus oscuros ayudantes, el zoosadista Adam Britton y el pederasta Peter Scully, para llegar a su universo desde su tiránica dimensión al haber creado Mediatown hace años como campo de estudio, habiendo perdido su caja dimensión para regresar tras un combate contra su enemigo Sabel, buscándola desde entonces. Pensando Media-San que quizá el pudo haber encontrado la caja hace años, todos regresan apresuradamente a Mediatown solo para encontrar a todos sus enemigos de lado de De Soto con la caja en su poder, trayendo al conquistador listo para conquistar su mundo. Revisando viejas cosas, Sally finalmente recuerda su infancia y el resto de sus años felices al encontrar los guantes que le confecciono el Sr. Kadabra.

13. El círculo de la esperanza-Doblegados por las fuerzas oscuras, la balanza se equilibra al llegar Midori y sus compañeros restantes al haberse refugiado con los Sésamo con refuerzos de todos los amigos que han hecho hasta ahora, también apareciendo Sabel e Isha. Justo a tiempo, Sally aparece para ayudar, rebelándose que De Soto no solo está por conquistar su mundo, sino por evitar una profecía que tres corazones puros lo derrotarían definitivamente al unir sus fuerzas, formando Media-Tan, Saki y Sally el triple circulo al ser ellas. Media-San da su vida para ayudar a su hermana y amante a hacer el círculo a costa de su propia vida, aunque renaciendo como fantasma al aún tener asuntos pendientes.

14. Búsqueda continua (Final de la serie)-Con la destrucción de De Soto, quedando encerrados en su dimensión mayoría de los Lost Media malos, despidiéndose Saki de sus amigas, los integrantes del equipo han tomado caminos separados, despidiéndose antes de partir. Media-Tan y Media-Kun se casaron, continuando residiendo en la nueva Mediatown, un lugar donde los Lost Media no malignos pueden vivir en paz, ayudando el Gordo Alberto a adaptarlos. Media-San y Saki con Midori y Doracat se mudan a Japón del Norte, continuando investigando anomalías con Sanobashi nuevamente como la buscadora representante del Lost Media en su tierra natal. Trope-Tan y Sly viajan alrededor del mundo. Wikipe-Tan es la nueva fuente de información del pueblo. Martina y Quirino continúan haciendo su trabajo en Latinoamérica. Mr. Softee continúa vendiendo helados para alegrar a los demás. Todos continúan viéndose por telecomunicación, como visitándose.