1. Pecados-Pasado un año de la resurrección de Superman, Coast City ah estado siendo reconstruida. Si bien Metrópolis ah recuperado en parte su vieja gloria, ahora muchos de sus ciudadanos ven con desconfianza a Superman por lo anterior acontecido. Además, Lois, que ha renunciado al ser Cat la nueva jefa editora del Planet, y él han decidido tomarse un tiempo. Desapareciendo partidarios suyos, los Supermanes enfrentan al sectario Gog, un sobreviviente de Coast City que se volvió loco y culpa al kriptoniano de sus desgracias, creyendo que es el Anticristo.

2. El hombre que lo tenía todo-Queriendo sus amigos y familia darle una sorpresa por su cumpleaños, descubren que la Fortaleza de la Soledad ah sido tomada por Mongul, habiendo infectado a Superman con un parásito espacial llamado Starro que lo hace vivir en una realidad paralela donde Kriptón no exploto y vivió una vida normal con esposa e hijos, chupándole la vida mientras más se adapte a esa falsa realidad. Además, Lobo ah llegado para reclamar el parásito por una recompensa.

3. El encargo-Nuevamente liderados por Bruno Mannheimm, Intergang vuelve a las andadas ahora con armas, trajes y tecnología capaces de rivalizar como someter a los Supermanes sin ningún problema en cada uno de sus crímenes cometidos. Mannheimm desea sacrificar a Superman bajo las creencias de su bizarra religión para coronarse como el rey del crimen. Sin embargo, además de eso, Intergang está buscando algo al excavar diversas zonas por todo el planeta.

4. Muerte no anunciada-Pese a que Mannheimm está bajo su custodia, se niega a revelar para quien está trabajando. Cuando Lex Luthor desde prisión sabotea la exploración al sol de Leo Quintum, el nuevo propietario y líder de Proyecto STAR, Superman salva su nave, además de derrotar permanentemente al infiltrado Metallo al lanzarlo al sol. Una vez en tierra, al analizar su sangre, Quintum le da la mala noticia que esta muriendo por sobreexposición solar en sus células.

5. Dulces sueños-Decidido a no contarle aún su estado agonizante a sus seres queridos y amigos, Superman convence a Lois de pasar tiempo juntos en la Fortaleza de la Soledad, obsequiándole un traje junto a una fórmula que emula sus poderes por 24 horas. Dando una vuelta, enfrentan a la misteriosa Granny Godness junto a sus Furias Femeninas, que le han estado lavando el cerebro a jóvenes al servicio de Darkseid, conociendo también a los extravagantes viajeros del tiempo, Sansón y Atlas que quieren su ayuda para resolver el acertijo sin respuesta de la Ultra Esfinge. Al final del día, Superman decide contarle su estado a Kara, Jimmy y Steel.

6. Trabajo para Jimmy Olsen-Dejando Quintum a cargo de Proyecto STAR a Jimmy por un día por visitar a seres de otra dimensión, se descubre accidentalmente un nuevo tipo de kriptonita, la roja. No teniendo efecto en un principio, pronto vuelve violento y malvado a Superman, pero el mayor problema no es ese, sino el regreso del espacio exterior de Doomsday ahora con poderes cósmicos, queriendo liberar la Zona Fantasma por el peligro que ambos representan.

7. Cooperación no esperada-Tras un nuevo juicio, Luthor ah sido sentenciado a pena de muerte, continuando culpando a Superman de todos sus males. Sintiendo más su deterioro, Clark entrevista a Lex en sus últimos días de vida. Producto de sus células fuera de control que ha absorbido Parásito, inicia un motín con el resto de presos, amenazando igualmente con explotar al resultar verdaderamente incontrolables. Ahora, y sin saberlo Lex, los enemigos deberán cooperar para escapar del infierno desatado, viendo que no son tan diferentes en realidad.

8. Funeral en Smallville-Superman visita Smallville para pasar tiempo con su madre adoptiva Martha, sin rebelarle su condición, solo confiando en Lana y Brainiac 5, continuándolo presionándolo los que saben su estado para que se lo diga a Lois. La visita amistosa no dura mucho al aparecer el temible y destructivo Kalibak junto al despiadado Stepphenwolf y sus Parademonios que se alimentan del miedo. Durante la pelea, a Superman le quitan tres minutos, que resultan ser los tres minutos durante los cuales fallece Martha de muerte natural.

9. Mundo bizarro-Tras un nuevo interrogatorio, Mannheimm rebela que está sirviendo al mayor tirano y genocida del universo encerrado en otra dimensión, Darkseid, y que solo el poder de las llamadas tres Cajas Madre podrán detener su llegada a la tierra. Continuando explorando diversos mundos paralelos, Quintum accidentalmente libera al cubico Mundo bizarro liderado por el primer defectuoso clon de Superman tras haber sido desterrado en su batalla. Ahora con su propio ejército de visiones bizarras de sus amigos y aliados con poderes, complica la tarea de mandarlos de vuelta a su mundo por su sol rojo.

10. Revanchismos-Sabiendo que Nueva Kriptón posee una de las Caja Madre por la descripción dada por Mannheimm, el planeta ha sido tomado por Preus, un álgido fanático de las ideas de Zod que considera débiles a los humanos junto a los kriptonianos traidores, preparando una invasión a gran escala para iniciar un imperio, no contando con que el tirano ah nombrado a Manchester Black como su mano derecha en la tierra. Consecuentemente, el estado de Superman sigue debilitándose aún más.

11. Camino hacia Atlantis-Con una de las cajas en su poder, la segunda se encuentra en la profunda ciudad submarina de Atlantis, liderada por Aquaman, según palabras de Mannheimm. El camino no será fácil no solo por la profundidad oceánica y los diversos peligros inusuales que hay, sino por la desconfianza del soberano de Atlantis hacia los visitantes y sus intenciones con la caja.

12. Sociedad matriarcal-Faltando una caja, poseyéndola las amazonas de Themyscira dirigidas por la reina Hypolita, el obtenerla será mucho más difícil por su sociedad aislacionista y que tiene desconfianza de los hombres. Sin embargo, Supergirl y Lois serán ayudadas por la joven hija de la reina, Diana, a superar las pruebas puestas donde medirán su valor e integridad, mientras los varones se enfrentan al guerrero de Nueva Génesis, Orión, que intenta advertirles sobre el peligro de las cajas.

13. Orígenes secretos-Teniendo las tres cajas en su poder, ahora como un gigante, Mannheimm rebela que todo fue una trampa para en realidad traer a Darkseid a su mundo, empezando Desaak la invocación, combatiendo los Supermanes a las hordas de Apokolips ayudados de Orión. Orión explica que hace siglos Nueva Génesis y Apokolips eran un solo planeta que se dividió resultado de una guerra civil iniciada por Ursas, el futuro Darkseid, en su afán de dominar el universo en su búsqueda por las Cajas Madre para activar la Ecuación Anti Vida donde controlaría la vida y la muerte. Se desato una guerra interestelar donde, gracias a los kriptonianos, se logró encerrar al tirano y su mundo en otra dimensión. Lo que no sabían los terrícolas era que las Cajas Madre contenían tres partes de Darkseid al haberse fusionado con ellas.

14. Darkseid-Pese a todos los esfuerzos por evitarlo, y estando Superman al final de su vida, diciéndole finalmente la verdad a Lois, Darkseid ha sido rearmado, siendo realmente imparable a comparación de cualquier enemigo anterior, pese a la llegada de refuerzos en todos los aliados y amigos que ha hecho en su travesía. Habiendo escapado de su ejecución por el caos, viendo el gran peligro que el tirano espacial representa, Luthor hace su primer y último acto de altruismo; dispara la fórmula, que obtuvo cuando intercepto la Fortaleza de la Soledad, que le daría habilidades kriptonianas, hacia Superman, que aunque no lo cura de su condición, le da nuevas fuerzas para hacerle frente a Darkseid, muriendo Lex al ser impactado por uno de sus rayos omega.

15. Inmortal (Final de la serie)-Producto de una cruenta y dura pelea, Superman ha empezado a desintegrarse, derrotando indirectamente a Darkseid al desintegrarlo por ser demasiada la energía. Llenos de miedo al ver morir a su amo, las fuerzas de Apokolips son devoradas por los Parademonios, seguidamente desintegrándose. En sus últimos momentos, Superman y Lois declaran su amor eterno al otro, compartiendo un último beso, despidiéndose de su familia y amigos, además de confiar la tierra a los Supermanes, muriendo tranquilo al saber que dejará todo en buenas manos. Cinco años después, Kara y Jimmy se casaron. Lois es madre de dos gemelos adolescentes, siendo Kal el padre, además de ser directora del Planet y dirigir una fundación junto a Lana y Brainiac 5. Steel ha convertido la Fortaleza de la Soledad en un museo dedicado a Superman. Superboy continúa enseñando a sus hermanos a manejar sus habilidades, creyendo ver durante una práctica de vuelo a su padre sonriendo surcar los cielos hacia el espacio exterior.