Raiden dịch chuyển đến Sky Temple để tìm kiếm thông tin nhưng ngài chỉ thấy được một nơi hoang tàn, nóc của toà tháp trung tâm cũng đã bị phá hủy hoàn toàn, khắp nơi ngổn ngang. Ngài bắt đầu nghi ngờ bản thân.

Mọi người ở trong trụ sở Special Forces đang làm việc riêng với nhau thì đột nhiên Kano cùng đám nhân bản Cyber Lin Kuei tấn công vào. Chúng bắt Sonya Blade và Johnny Cage đi. Chúng sau đó rút lui hết rồi để lại quả bom cảm tử Sektor. May mắn rằng Raiden đã về kịp và dịch chuyển tất cả mọi người đến Fire Garden của Shirai Ryu. Giáo chủ Hasashi Hanzo ra tiếp đón họ. Raiden chắp tay cảm tạ trước rồi lịch sự nói:

- Giáo chủ Hasashi, tôi mạn phép cầu khẩn lòng hiếu khách của Shirai Ryu. Sky Temple của tôi đã bị phá hủy, không còn nơi nào khác an toàn để tụ họp

Hanzo có chút nghi ngờ với đề nghị của Raiden, không phải sợ ngài ấy nói dối mà là sợ ngài ấy gây hoạ cho Shirai Ryu như cách ngài ấy đã từng. Nhưng dù gì người từng cứu anh cũng là Raiden nên anh vẫn rất tôn trọng ngài.

- Ngài Raiden. Chào mừng đến với Fire Garden - Hanzo kính cẩn cúi chào

Mọi người vào trong đền Shirai Ryu để nghỉ ngơi còn Raiden đến thiên đàng một lần nữa, hy vọng tìm thấy một cổ thần khác. Nhưng hiện thực đã tát vào mặt của ngài, ngài chẳng tìm thấy được gì ngoài đống đổ nát.

Dòng kí ức từ tương lai đột nhiên ập vào não của Raiden khiến ngài nhất thời chưa thích nghi được. Ký ức mơ hồ về ba đứa con mà ngài chưa được gặp mặt đã hiện lên. Có lẽ ngay lúc này đây quá khứ và tương lai của ngài đã hoàn toàn hợp nhất. Đứa trẻ tội nghiệp Kusanagi bị chính tay ngài đâm chết, Kagami bị chính tay ngài cắt đôi. Raiden bị đả kích nặng nề khi nhìn thấy những hình ảnh đó.

Lần theo manh mối trong kí ức, Raiden tìm tới nơi có bia mộ của Kusanagi và Kagami. Ngài khẽ vuốt bia mộ, ngài đau khổ khi chính mình đã gây ra tội ác này.

- Tại sao? Tại sao chứ? Chẳng lẽ...tất cả là lỗi tại mình sao?

Raiden bỗng cảm thấy nhói đầu, có một bóng hình nào đó khác xuất hiện trong kí ức của ngài. Nhưng ngài không thể biết mặt của người đó, ngài chỉ có thể thấy được một cái bóng đen đã từng chăm sóc, yêu thương ngài lúc ngài sa cơ. Người đó là ai, ngài không thể biết, dường như người đó không thuộc về thế giới này.

Thần sấm kiểm tra lại dấu tích trên bia mộ thì phát hiện ra bia mộ của Kagami chỉ vừa mới được đắp. Có nghĩa rằng phiên bản tương lai của ngài thực sự là một tên xấu xa tàn bạo.

Bầu trời tối sầm và suýt mưa nhưng Raiden đã nhanh chóng chấn chỉnh lại bản thân, không muốn bất kì ai nhìn thấy sự yếu mềm của ngài.

Raiden sau đó quay về Fire Garden báo tin, tâm trạng của ngài vô cùng nặng nề.

- Các cổ thần đã không còn nữa sao? Shinnok là con trai của Kronika? Thảo nào bà ta cử Black Dragon tới chỗ tôi và bố. Hắn bị bố con tôi đánh không trượt phát nào mà - Cassie Cage tỏ vẻ vô cùng ngạc nhiên như bao người khác

Raiden bắt đầu giải thích:

- Thứ Kronika tìm kiếm không phải là sự trả thù. Bà ta muốn tái thiết lập lại dòng thời gian để cân bằng ánh sáng và bóng tối giữa các cõi

Liu Kang lo lắng hỏi:

- Chúng ta nên làm gì đây ngài Raiden?

- Tập hợp nguồn lực từ Earthrealm. Nhưng những nỗ lực đó sẽ vô nghĩa nếu như quân đội của Kotal Kahn không gia nhập với chúng ta. Cetrion đã nói với ta rằng Shao Kahn đã bắt giữ Kotal Kahn. Chúng ta phải trả tự do cho ông ta bằng mọi giá - Raiden nói, ánh mắt của ngài tràn đầy sự quyết tâm

Liu Kang:

- Kung Lao và con sẽ đi ạ. Chúng con sẽ tụ họp với công chúa Kitana

- Cảm ơn hai con. Cầu cho các cổ thần sẽ bảo... - Raiden bỗng ngừng câu cửa miệng lại khi sực nhớ ra các cổ thần đã không còn. Ngài thở dài một tiếng rồi nói tiếp - Chúc các con thắng lợi trở về

Liu Kang và Kung Lao đến Outworld để trợ giúp Kitana thuyết phục Sheeva giúp đỡ nhưng Sheeva yêu cầu có sự tham gia của tộc Takartan mới đồng ý liên minh. Họ đành phải tới tận hang ổ của Takartan, Liu Kang và Kung Lao giả vờ làm lính và diễn như thể họ vừa bắt được Kitana. Nhưng mọi chuyện sớm bị bại lộ khi Skarlet - một ả phù thủy dùng pháp thuật máu đánh hơi ra được.

(Skarlet)

Jade, Kitana, Kung Lao và Liu Kang cùng nhau chống trả quyết liệt với cả một bộ tộc Takartan. Sau khi Kitana đánh bại Baraka thì đã thuyết phục hắn theo phe của Kotal Kahn. Sau nhiều lần suy nghĩ, Baraka cũng đã đồng ý gia nhập quân của Kotal Kahn. Sau khi tộc Takartan bắt tay với Kitana, Sheeva cùng tộc Shokan cũng tham gia lực lượng nốt.

Quân khởi nghĩa cùng nhau đánh vào đấu trường nơi Kotal Kahn sắp bị Shao Kahn xử tử. Phe của Shao Kahn và phe của Kotal Kahn lại lao vào đánh nhau tiếp. Sau khi Kotal Kahn được giải thoát thì đã tiếp tục lao lên đánh tay đôi với Shao Kahn. Nhưng mà Shao Kahn vẫn quá mạnh so với Kotal Kahn. Chỉ sau vài đòn, Kotal đã bị hạ gục và suýt bị Shao Kahn giết nếu không được Kitana cứu.

Kitana lao đến đánh bại Shao Kahn và chém mù mắt hắn. Kitana đã nhận được sự công nhận của Kotal Kahn và toàn dân Outworld rồi trở thành Kahn mới.

Sau khi Kitana đã thống nhất được Outworld, Liu Kang và Kung Lao đã về báo tin cho Raiden.

Tin tức này đã thắp lên một hy vọng cho phe chính nghĩa.

- Tin tức từ Outworld đúng là đáng mong đợi. Nhưng vị trí điện thờ của Kronika vẫn còn là một bí ẩn. Nó không nằm trong các cõi, nó nằm ở ngoài tầm nhìn của tôi - Raiden nói

Hanzo, lúc này nảy ra một ý tưởng:

- Ông có biết Kharon không Raiden?

Kuai Liang phụ hoạ theo:

- Đúng rồi nhỉ, Kharon

Raiden thắc mắc:

- Kharon là ai?

- Chủ nhân của con tàu cái chết. Sub - Zero và tôi đã từng gặp ông ta từ hồi chúng tôi là Revenant - Hanzo đáp

Kuai Liang nói tiếp:

- Ông ta có thể du hành khắp vũ trụ, khắp các cõi, chuyên chở những linh hồn tội lỗi từ khắp nơi tới Netherrealm

- Nếu điện thờ nằm ở đâu đó ngoài kia thì Kharon sẽ biết vị trí - Hanzo nói

- Ông ta sẽ giúp chúng ta chứ?

- Có khả năng nhưng không dám chắc

- Mong hai cậu sẽ đi điều tra thật nhanh

- Chúng tôi sẽ đi ngay - Hanzo nói sau khi đặt tay lên ngực mình cùng Kuai Liang như một hành động thề

Sau khi Raiden bàn với Hanzo và Kuai Liang xong thì Cassie tiến lên bày tỏ về kế hoạch của mình:

- Có được đội quân của Outworld rất là hữu ích. Nhưng tôi sẽ cảm thấy an toàn hơn nếu có thêm người

- Thiếu Lâm Tự sẽ giúp chúng ta. Kung Lao và Liu Kang sẽ tới đó để giúp các nhà sư chuẩn bị - Raiden đáp

- Tốt. Tôi cũng sẽ chuẩn bị rời đi để tìm Johnny và Sonya - Cassie nói

Jax quá khứ và Jacqui cũng muốn đi theo. Nhưng Cassie khuyên họ ở lại để hỗ trợ Raiden kiểm soát thông tin. Nhưng Raiden đã nói rằng cứu Sonya rất quan trọng và khuyên họ nên đi cùng nhau. Ngài cũng giải thích rằng Kronika rất mạnh nhưng bà ta chưa phải là toàn năng, bà ta cần thu thập sức mạnh để có thể tái thiết lập dòng thời gian. Bà ta cần Jinsei và chỉ còn lại giếng linh hồn trên đảo Shang Tsung là còn loại năng lượng đó.

Cuối cùng Cassie cùng đội của mình đi cứu Sonya và Johnny quá khứ. Còn Jax quá khứ và Jacqui đến đảo Shang Tsung để điều tra trong khi Raiden quan sát xem Kronika đang phá hoại những gì trong dòng thời gian.

Raiden cảnh báo Cassie về việc nếu Johnny hoặc Sonya quá khứ chết thì Cassie sẽ biến mất. Dù vậy cô nàng cũng không lùi bước, quyết đi cứu cha mẹ mình.

Cassie thuận lợi cứu được cha mẹ, Sonya còn khiến Kano biến mất bằng cách bắn tung sọ của Kano quá khứ. Geras xuất hiện để chặn họ lại nhưng với sự thông minh của mình thì họ đã giữ chân được Geras và rút lui thành công.

Lúc này ở phòng chứa đồng hồ cát của Kronika, bà ta vẫn đang nhào nặn dòng thời gian. Không một ai hiểu bà đang nghĩ gì. Bà ta vốn có thể ngăn chặn sự thống nhất của Outworld và bóp nát lực lượng của Earthrealm từ đầu. Nhưng bà ta không làm vậy, lý do gì bà ta phải để yên cho phe đối lập của mình chống cự mạnh mẽ thế chứ.

Ở đâu đó trong tâm trí của Kronika, bà vẫn ôm hy vọng rằng sẽ có ai đó đến và giải thoát bà khỏi sự điên rồ này. Bà vốn không muốn chúng sinh đau khổ, chỉ là bà đã mất trí rồi.

"Chìa khoá đó sẽ mở ra tương lai một lần nữa nếu như ta tự tay đóng nó lại vào một ngày nào đó. Hãy đến và giải thoát cho ta. Ta yêu các con."