1. Desenterrando el pasado-Pasado un año de la destrucción de Brainiac, con Jimmy guardando su secreto, Superman aún piensa en que debe decirle la verdad a Lois al estar teniendo citas como Clark. Ahora sabiendo más sobre Kriptón, ha estado explorando el ártico en busca de una ciudadela kriptoniana construida hace siglos como estación de exploración, en la fría tundra enfrentara a Equus, un organismo biocibernetico letal, además de acompañarlo Jimmy sin quererlo.

2. Reunión familiar-Llamando a la ciudadela la Fortaleza de la Soledad, revisando el lugar, descubre una capsula que contiene a una joven kriptoniana llamada Kara Zor El, una prima de Superman, sintiendo Jimmy atracción hacia ella. Mientras tanto en Metrópolis, la antipática estrella de cine y televisión Albert Michaels se convierte en Atomic Skull al ser accidentalmente impactado por radiación en medio de un robo a Lexcorp que Superman detiene, queriendo destruir al hombre de acero al verlo como el villano de su historia.

3. Bienvenida inesperada-Superman y Jimmy enseñan a Kara a dominar sus habilidades, continuando sin recordar nada antes de su criogenización. En la ciudad, el empresario, filántropo y dueño de la multinacional Lexcorp, como candidato a la presidencia de los Estados Unidos, Lex Luthor, regresa a Metrópolis tras una estadía en Ciudad Central, siendo secuestrado para pedir rescate por Bloodsport, un astuto y peligroso mercenario que usa cualquier objeto a su mano como arma, cargando muchas de kriptonita, viendo Lex por primera vez en acción a Superman.

4. Su nombre es Hellgramite-Jimmy cree que Kara está lista para salir al exterior, permitiéndolo Superman pese a sus aún dudas, atendiendo su trabajo y saliendo con Lois como Clark, haciéndola pasear Olsen por Metrópolis. En Lexcorp, un gigantesco saltamontes busca asesinar a Lex Luthor al culparlo de su mutación, saliéndose de control cuando el ahora nombrado Hellgramite toma control de las personas al secretarles su mucosa.

5. Neutrones-Trabajando como guardia de seguridad, el malhumorado y abusivo esposo de Cat Nathaniel Tyron roba una batería experimental que al manipularla lo transforma en Neutrón, un ser capaz de proyectar grandes explosiones de energía, pronto declarándose un dios entre hombres, entrando Supergirl en acción, pronto llamando la atención pese a las discrepancias de su primo, molestándole a Lex la presencia de otro kriptoniano.

6. Reliquia llegada-Sorpresivamente, en medio de una charla de Clark y Lois sobre las cosas que el primero oculta y quiere rebelarle, dándose un nuevo beso, llega del espacio una nave que transporta al General Zod, otro kriptoniano sobreviviente, junto a su gran lobo albino mascota Krypto, buscando la ayuda de Superman para deshacerse del molestoso Mr. Mxyzptlk que les ha estado causando problemas, complicándose cuando Lobo también quiere capturarlo para cobrar una recompensa.

7. Cambio de último momento-Superman y Kara conoce más de cerca a los supervivientes kriptonianos en la gran nave, Zod que Jor El y eran los mejores amigos, junto a la verdadera razón de su llegada; hace un año un científico llamado Jax Ur se rebeló y escapo a la tierra con tecnología kriptoniana. En la tierra, Silver Banshee vuelve a aparecer, queriendo poseer el cuerpo de una persona ideal para continuar su vida normal, aunque no queriendo lastimarla.

8. Odios arraigados-Lois y Jimmy no confían en Zod, teniendo Superman sus dudas, siendo Kara la más dispuesta a confiar en él, al recibir entrenamiento por parte de su segunda al mando, Faora, continuando en busca de un rastro de Jax Ur. En su guarida, la Juguetera reorganiza al Superman Revenge Squad, contando Metallo ahora con brazos mecánicos, agregando a Atomic Skull, Hellgramite, Neutrón y Bloodsport a sus filas para su versión retorcida de Disneylandia. La mayor presencia de kriptonianos hace que Luthor intente convencer al gobierno estadounidense de una aparente invasión para deshacerse de ellos, rechazándolo, solo aumentando el odio de Lex.

9. Rompecabezas-El afamado profesor universitario experto en cálculos y matemáticas, Milton Fine, desafía públicamente a Superman a superar una serie de retos transmitidos en vivo. Ignorándolo inicialmente por estar ocupados con Jax Ur, el hombre de acero finalmente accede, sin sospechar que en realidad Fine es un criminal llamado Puzzler, siendo los juegos una trampa para que sus secuaces roben todos los lugares valiosos posibles sin su intervención.

10. Disfraz a la vista-Tras días sin tener una noticia del científico kriptoniano, el cuarteto finalmente descubre que ha estado haciéndose pasar como un científico en Lexcorp. Planeando una infiltración bastante cuidadosa, no siendo fácil por el alto nivel de seguridad, principalmente que ejerce la mano derecha de Luthor, Mercy Graves, logran capturar al científico rebelde tras un combate, habiendo usado kriptonita azul para ocultar sus habilidades. Pasado el incidente, Lex lo toma como algo bastante personal.

11. Intención pendiente-Llevando al científico ante Zod, el general rebela su verdadera cara al capturarlos y encerrarlos en su nave, siendo realmente el tío materno de Kal El, al cual odia al considerarlo un bastardo al estar enemistadas sus familias. En realidad, Jax Ur fue enviado a la tierra para investigar cuanto había cambiado el planeta que una vez intento terraformar a base de Kriptón como parte de una exploración a otros mundos, buscando devolver a su tamaño a la miniaturizada capital kriptoniana de Kandor, siendo por eso que construyeron la ciudadela, lugar donde Zod continuara su plan tras escapar de la Zona Fantasma, acompañándolo voluntariamente Kara para consternación de los demás al querer su planeta de vuelta.

12. Recuerdos borrados-Intentando escapar de su celda de energía solar roja, Superman siente culpa por meter a su mejor amigo y mujer que ama en ese problema, volviéndole el ánimo gracias a Lois. Cansados de los maltratos y vejaciones del general, los demás kriptonianos los ayudan a escapar. En la Fortaleza, además de pensar en la nueva vida que ahora tiene y los que le importan, Kara finalmente recuerda lo que le paso; Zod asesino a sus padres cuando se negaron a seguir colaborando, encerrándola en esa cápsula, llegando justo a tiempo su primo y compañía para hacer frente al tirano kriptoniano, encargándose Kara de Faora, haciendo frente Lois y Jimmy a Jax Ur y demás subordinados con armas de energía solar roja, uniéndose Krypto a sus filas al haber sido maltratado constantemente por su dueño.

13. Combate sanguíneo-Superman y Zod continúan batiéndose a duelo, siendo una batalla equiparada hasta quebrar su sobrino su traje a prueba del ambiente terrícola, donde el orgulloso general no puede soportar la vida del planeta junto a todos sus sonidos, acabando Kal con su vida al negarse a rendirse. Los kriptonianos restantes deciden establecer su hogar en otro planeta, rechazando Kara la oferta para quedarse con Jimmy. Reunidos en privado, Lois rebela que ya tenía sospechas que Clark era Superman, haciéndole prometer que no le mentira de nuevo. En su oficina, Luthor está frustrado y planea librar al mundo del hombre de acero, ofreciéndose Sam para ayudar.